Μεταλλάξεις: 625 νέα κρούσματα της Δέλτα, 351 κρούσματα της Όμικρον

Μεταλλάξεις: 625 νέα κρούσματα της Δέλτα, 351 κρούσματα της Όμικρον

Ολοκληρώθηκε από το Eθνικό Δίκτυο Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2, που λειτουργεί υπό το συντονισμό του ΕΟΔΥ,  γονιδιωματική ανάλυση σε 1.007 δείγματα που έχουν επιλεγεί τυχαιοποιημένα ή στοχευμένα και αφορούν στην περίοδο 01 Δεκεμβρίου 2021 έως 03 Ιανουαρίου 2022.

Από τον έλεγχο των 1.007 δειγμάτων, αναδείχθηκαν συνολικά 976 δείγματα με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος (Variants Of Concern – VOC). Εκ των 976 δειγμάτων με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος, τα 625 αφορούν στο στέλεχος Delta, και 351 αφορούν στο Omicron (Πίνακας 3).

Δεκαεπτά εκ των 625 στελεχών Delta αφορούν στο στέλεχος Α.Υ.4.2, τα οποία εντοπίστηκαν σε δεκαεπτά εγχώρια κρούσματα στις Περιφερειακές Ενότητες της Αργολίδας (13), του Βορείου Τομέα Αθηνών (1), του Λασιθίου (2) και της Λέσβου (1).

Από την έναρξη λειτουργίας του Εθνικού Δικτύου Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2 μέχρι σήμερα έχουν ελεγχθεί στην επικράτεια συνολικά 43.888 δείγματα από εγχώρια κρούσματα. Εξ αυτών 39.512 προέρχονται από τυχαία επιλογή δειγμάτων, 3.635 προέρχονται από στοχευμένη λήψη ή επιλογή δειγμάτων και για 741 δείγματα δεν είναι διαθέσιμος ο τρόπος επιλογής.

Μεταξύ των 39.512 τυχαία επιλεγμένων δειγμάτων στην επικράτεια, τα τέσσερα πιο συχνά στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση που έχουν απομονωθεί είναι το Delta με ποσοστό 46,93%, ακολουθούμενο από το Alpha με ποσοστό 39,39%, το B.1.1.318 (Variant E484K) με ποσοστό 5,93%, και το Omicron με ποσοστό 1,45% (Πίνακας 4).

Η διαχρονική εξέλιξη της σχετικής συχνότητας των αλληλουχηθέντων δειγμάτων από τυχαία δειγματοληψία ανά είδος στελεχών, μέχρι και την εβδομάδα 52 του 2021 απεικονίζεται στο Διάγραμμα 9.

Από τα 3.635 δείγματα που έχουν ληφθεί ή επιλεγεί στοχευμένα, έχουν βρεθεί 3.472 στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση ή ενδιαφέροντος. Από τα δείγματα που έχουν ληφθεί ή επιλεγεί στοχευμένα, 36,62% αφορούν στο Delta, 36,04% αφορούν στο B.1.1.318 (Variant E484K), 14,83% στο Alpha, 5,56% στο Beta, 2,09% στο Omicron, 0,11% στο C.36, 0,08% στο Eta, 0,08% στο Gamma, 0,08% στο A.28 και 0,03% στο Mu.

Επιπλέον, έχουν απομονωθεί συνολικά 547 στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος ή υπό παρακολούθηση ή ενδιαφέροντος από δείγματα εισαγόμενων κρουσμάτων, εκ των οποίων 330 αφορούν στο Delta, 113 στο Alpha, 83 στο Omicron, 7 στο Mu, 6 στο Beta, 4 στο B.1.1.318 (Variant E484K), 1 στο Eta, 1 στο C.36, 1 στο Kappa, 1 στο B.1.1 (Variant E484K).

Όσον αφορά στα στελέχη ενδιαφέροντος που χρήζουν άμεσης λήψης μέτρων ελέγχου επί του παρόντος στη χώρα, η γεωγραφική κατανομή ανά Περιφερειακή Ενότητα παρουσιάζεται στον πίνακα 5.

Η παραλλαγή Omicron (B.1.1.529/BA.1) χαρακτηρίζεται από την παρουσία μιας διαγραφής νουκλεοτιδίων, της διαγραφής 69-70 (del69-70) στο γονίδιο S (Spike) του ιού.

Η διαγραφή αυτή έχει ως αποτέλεσμα την αδυναμία ενίσχυσης ενός εκ των τριών γονιδιακών στόχων, του γονιδίου S, σε συγκεκριμένη εμπορικά διαθέσιμη διαγνωστική δοκιμασία μοριακού ελέγχου (RT-PCR), που εφαρμόζεται σε ορισμένα εργαστήρια στη χώρα μας και ευρύτερα παγκοσμίως.

Επιπλέον, προκαταρκτικός έλεγχος για πιθανά κρούσματα του στελέχους Όμικρον, πραγματοποιείται και με εναλλακτικά πρωτόκολλα μοριακού ελέγχου (RT-PCR), που στοχεύουν στην ύπαρξη συγκεκριμένων μεταλλάξεων σε διαφορετικές περιοχές του γονιδίου S, οι οποίες είναι ειδικές για το στέλεχος Όμικρον.

Θετικά δείγματα που έχουν ελεγχθεί με τα συγκεκριμένα πρωτόκολλα μοριακής διάγνωσης και χαρακτηρίζονται από αδυναμία ενίσχυσης του γονιδίου S, εγείρουν ισχυρή υποψία ότι πρόκειται για πιθανά κρούσματα του στελέχους Όμικρον (B.1.1.529/BA.1) στην παρούσα φάση της πανδημίας.

Η αξιολόγηση του συγκεκριμένου μοριακού ευρήματος κατά τον μοριακό έλεγχο (αδυναμία ενίσχυσης του γονιδίου S) επιτρέπει μια προκαταρκτική εκτίμηση σε πραγματικό χρόνο της επίπτωσης της Όμικρον (B.1.1.529/BA.1) στο σύνολο των θετικών μοριακών ελέγχων.

Η ακριβής εκτίμηση της επίπτωσης της Όμικρον μπορεί να γίνει μόνον με την αλληλούχιση του πλήρους γονιδιώματος του ιού από αντιπροσωπευτικά θετικά δείγματα (γονιδιωματική επιτήρηση).

Ακολουθεί διάγραμμα (Διάγραμμα 10) της διαχρονικής εξέλιξης των εν λόγω δειγμάτων στο σύνολο των θετικών μοριακών ελέγχων που διενεργούνται σε δείγματα, αντιπροσωπευτικά του μεγαλύτερου μέρους της Επικράτειας.

ΔΙΑΒΑΣΤΕ ΕΠΙΣΗΣ:

Επιδημιολογικός χάρτης: 1.966 νέα κρούσματα στη Θεσσαλονίκη – 7.758 στην Αττική

Κορωνοϊός: 20.409 νέα κρούσματα – 80 θάνατοι – 664 διασωληνωμένοι

Δένδιας από τη Βρέστη: Η ΕΕ πρέπει να αντιμετωπίσει τις απειλές στην Αν. Μεσόγειο 

Στόχος διαρρηκτών για 9η φορά ζαχαροπλαστείο στην ανατολική Θεσσαλονίκη (ΦΩΤΟ)

Πύργος-Κορωνοϊός: Επιχειρηματίας κατέληξε έξι μήνες μετά τον θάνατο του γιου του

Κορωνοϊός: Δύσκολη η εφημερία στο ΑΧΕΠΑ – 55 οι εισαγωγές ασθενών

Κορωνοϊός: Δύο χρόνια από τον πρώτο νεκρό στην Κίνα

Αναστασιάδης: Τον Μάρτιο η «συνάντηση κορυφής» της ελληνικής ομογένειας στη Θεσσαλονίκη (ΗΧΗΤΙΚΟ)

Τσίπρας: Θα μπορούσα να πάω στη βουλή και να κολλήσω συναδέλφους (ΦΩΤΟ)

Θεσσαλονίκη: Εξιχνιάστηκαν διαδικτυακές απάτες άνω των 10.000 ευρώ

Βέροια: Συνελήφθη 64χρονος καταδικασμένος σε 77,5 χρόνια φυλάκισης για παράνομη μεταφορά μεταναστών

Δείτε τις ειδήσεις από την Ελλάδα και όλο τον κόσμο στο GRTimes.gr

Ακολουθήστε το GRTimes στο Google News και ενημερωθείτε πριν από όλους

ΡΟΗ ΕΙΔΗΣΕΩΝ