ΕΚΠΑ-κορωνοϊός: Πώς εντοπίζεται το ιικό φορτίο στα λύματα

ΕΚΠΑ-κορωνοϊός: Πώς εντοπίζεται το ιικό φορτίο στα λύματα

Με αφορμή την εν εξελίξει πανδημία που οφείλεται στον SARS-CoV-2, διεπιστημονική ομάδα του ΕΚΠΑ προέβη στη βιβλιογραφική ανασκόπηση και καταγραφή των μεθοδολογιών προσδιορισμού του ιικού φορτίου στα λύματα.

Η βιβλιογραφική ανασκόπηση και καταγραφή έγινε υπό την καθοδήγηση του καθηγητή Αναλυτικής Χημείας Νικόλαου Θωμαΐδη και συνσυγγραφείς τους Νικ. Αλυγιζάκη, Αθ. Μάρκου, Νικ. Ρούση, Κατ. Γαλάνη, Mαργ. Αυγέρη, Παν. Αδαμόπουλο, Ανδ. Σκορίλα, Ευ. Λιανίδου, Δημ. Παρασκευή, Σωτ. Τσιόδρα, Αθ. Τσακρή και Θάνο Δημόπουλο (πρύτανη ΕΚΠΑ).

Το άρθρο συνοψίζει τις υπάρχουσες μεθοδολογίες που έχουν εφαρμοστεί σε παγκόσμια κλίμακα και δημοσιεύτηκε στο διεθνούς φήμης και μεγάλης απήχησης (Impact Factor 9.8) περιοδικό Trends in Analytical Chemistry. Αφορμή αποτέλεσε η καθημερινή παρακολούθηση του ιικού φορτίου του SARS-CoV-2 στα αστικά λύματα του Κέντρου Επεξεργασίας Λυμάτων (ΚΕΛ) της Ψυττάλειας (ΕΥΔΑΠ), που πραγματοποιείται από το Εργαστήριο Αναλυτικής Χημείας για την καταγραφή της διασποράς της νόσου COVID-19 στο λεκανοπέδιο Αττικής. Τα αποτελέσματα υποβάλλονται καθημερινά στη Γενική Γραμματεία Δημόσιας Υγείας και στην Επιτροπή Εμπειρογνωμόνων του υπουργείου Υγείας.

Από την προαναφερθείσα ανασκόπηση και την καταγραφή είναι έκδηλη η ανάγκη παρακολούθησης της εξέλιξης της πανδημίας, μέσω μη παρεμβατικών και με χαμηλό κόστος εργαλείων, όπως η Επιδημιολογία Λυμάτων. Με την εφαρμογή αυτής της μεθοδολογίας αναπτύσσεται ένα σύστημα έγκαιρης και έγκυρης προειδοποίησης, που αποτελεί αρωγό των αρμόδιων Αρχών στη λήψη σωστών αποφάσεων την κατάλληλη στιγμή.

Οι συνθήκες φύλαξης των δειγμάτων, τα στάδια προσυγκέντρωσης και απομόνωσης του ιικού φορτίου είναι ιδιαίτερα κρίσιμα και πρέπει να ελέγχονται με εξωγενή πρότυπα και πειράματα επικύρωσης, ώστε να πραγματοποιείται ο έλεγχος ποιότητας της μεθοδολογίας και να εξασφαλίζεται η αξιοπιστία των αποτελεσμάτων. Η ανίχνευση του ιικού φορτίου πραγματοποιείται με την τεχνική της RT-qPCR, η οποία παρέχει υψηλή ευαισθησία και απόδοση με χαμηλό κόστος. Λόγω της πολυπλοκότητας του αντικειμένου και της άμεσης ανάγκης για ευαίσθητες και αξιόπιστες μεθοδολογίες, απαιτείται περαιτέρω έρευνα για τη βελτίωση των κομβικών σημείων που επηρεάζουν την ανάλυση.

Η εργασία που δημοσιεύτηκε από τη διεπιστημονική ομάδα του ΕΚΠΑ αποτελεί εφαλτήριο και προαπαιτούμενη γνώση για τις έρευνες που εκπονούνται όσον αφορά την ανίχνευση του SARS-CoV-2 στα λύματα. Παράλληλα, διενεργούνται σημαντικές ερευνητικές προσπάθειες σε πολλές ακαδημαϊκές μονάδες του ΕΚΠΑ.

Οι επόμενες εργασίες σχετικά με την παρουσία του SARS-CoV-2 στα λύματα αφορούν:

  • Την ανάπτυξη και επικύρωση νέου μοντέλου υπολογισμού των μολύνσεων από SARS-CoV-2 στην περιφέρεια της Αττικής σε καθημερινή βάση από τα λύματα.
  • Την ανάπτυξη πρωτότυπων και υπερευαίσθητων νέων μοριακών μεθοδολογιών για την ανίχνευση και αλληλούχηση του ιού SARS-CoV-2 σε αστικά λύματα και σε κλειστές δομές, οι οποίες αναμφισβήτητα αποτελούν εστίες υπερμετάδοσης (υπό τον συντονισμό του καθηγητή Κλινικής Βιοχημείας Ανδ. Σκορίλα).
  • Την ανάπτυξη μίας πολλαπλής RT-ddPCR με σκοπό την άμεση, απόλυτη ποσοτικοποίηση του αριθμού των αντιγράφων του ιού σε κλινικά δείγματα χωρίς την ανάγκη εξωτερικής βαθμονόμησης (υπό τον συντονισμό της καθηγήτριας Αναλυτικής και Κλινικής Χημείας Ε. Λιανίδου). Η droplet digital PCR (ddPCR) αποτελεί μία εξελιγμένη τεχνική ποσοτικής PCR με πολλά πλεονεκτήματα ως προς την αναλυτική ευαισθησία. Το κύριο πλεονέκτημα της αναπτυσσόμενης πολλαπλής RT-ddPCR έναντι της RT-qPCR είναι η πολύ καλή ειδικότητα και η ακρίβεια στον ποσοτικό προσδιορισμό σε πολύ χαμηλά επίπεδα συγκεντρώσεων ιικού φορτιού.
  • Την εφαρμογή μεθοδολογιών με ddPCR για την ποσοτικοποίηση των αντιγράφων του SARS-CoV-2 που βρίσκονται στα λύματα με χαμηλό ιικό φορτίου λόγω της υψηλής ευαισθησίας και ακρίβειά της.

Σύσσωμη η ερευνητική κοινότητα του ΕΚΠΑ συνεργάζεται με σκοπό να συμβάλλει στην αναχαίτιση της πανδημίας. Μέσω της διεπιστημονικής προσέγγισης, της ανταλλαγής γνώσεων και εμπειρίας των ερευνητικών ομάδων του ΕΚΠΑ και της ενδελεχούς προσπάθειας, οι εργασίες που έπονται θα συνδράμουν σημαντικά στην κατανόηση της παρούσας γνώσης και θα την τροφοδοτήσουν με νέα, ενώ παράλληλα θα προσφέρουν χρήσιμα όπλα για την πρόληψη, τον περιορισμό και την αντιμετώπιση της πανδημίας.

ΣΗΜΑΝΤΙΚΕΣ ΕΙΔΗΣΕΙΣ

00:0724/01

Πουκάμισο: βασικό κομμάτι της γυναικείας γκαρνταρόμπας Lifestyle

00:0024/01

Ισπανία: Παραιτήθηκε ο στρατηγός των Ενόπλων Δυνάμεων, επειδή εμβολιάστηκε νωρίτερα Διεθνή ,Κορωνοϊός

23:5523/01

Πρώτη επικοινωνία του Μπ. Τζόνσον με τον Τζο Μπάιντεν Διεθνή

23:5323/01

Το Στέιτ Ντιπάρτμεντ καταδικάζει τη «βίαιη καταστολή» των διαδηλώσεων στη Ρωσία Διεθνή

23:4523/01

Επίσκεψη Αλκ. Στεφανή στην Κρήτη και την Γαύδο Πολιτική

23:3523/01

Την επόμενη εβδομάδα η καταβολή του επιδόματος θέρμανσης Κοινωνία ,Οικονομία

23:3023/01

Το Ριάντ προσβλέπει σε «εξαιρετικές σχέσεις» με τη νέα κυβέρνηση Μπάιντεν Διεθνή

23:2623/01

Τήνος: Σύλληψη Ρώσου για παράνομη είσοδο στην Ελλάδα Ελλάδα

23:1523/01

Ολοκληρωμένο Σχέδιο για τον Οινοτουρισμό, παρουσιάζει ο Δήμος Αριστοτέλη Δήμοι

23:0523/01

ΣΥΡΙΖΑ: Ο πρωθυπουργός βρίσκεται υπό την ομηρία του κ. Σαμαρά Κόμματα ,Πολιτική

23:0023/01

Δικογραφία για καλλιέργεια κάνναβης στον Μυλοπόταμο Χωρίς κατηγορία

22:5723/01

Το μήνυμα της νοσηλεύτριας του Ευαγγελισμού που συγκίνησε και τον Κικίλια Κορωνοϊός ,Υγεία

22:5123/01

Μαγνησία: Δεκάδες κρούσματα covid-19 σε γηροκομείο Κοινωνία ,Κορωνοϊός

22:4523/01

AstraZeneca: 3 εκατ. δόσεις το Φεβρουάριο στη Γερμανία Διεθνή ,Κορωνοϊός

22:4523/01

Κύπρος: Τέσσερις θάνατοι και 129 νέα κρούσματα κορωνοϊού Διεθνή ,Κορωνοϊός

22:4423/01

Μόσιαλος: Απαιτείται να είμαστε προσεκτικοί – Πώς θα καθυστερήσουμε το τρίτο κύμα Κοινωνία ,Κορωνοϊός

22:3023/01

Εμβόλιο: Η Γαλλία τάσσεται υπέρ της αύξησης του διαστήματος μεταξύ των δύο δόσεων Διεθνή ,Κορωνοϊός

22:2223/01

Φωτιά σε αποθήκη στον Χορτιάτη Θεσσαλονίκης (VIDEO) Θέματα GR Times ,Θεσσαλονίκη ,Κοινωνία

22:1523/01

Πορτογαλία-κορωνοϊός: Ρεκόρ νέων κρουσμάτων και θανάτων Διεθνή ,Κορωνοϊός

22:0523/01

Η Ε.Ε. καταγγέλλει «δυσανάλογη χρήση βίας» εναντίον των διαδηλωτών υπέρ του Ναβάλνι Διεθνή

22:0023/01

Θεσσαλονίκη: Εξιχνιάστηκαν κλοπές από αυτοκίνητα σε κεντρικούς δρόμους Θεσσαλονίκη

21:5823/01

Βίντεο ντοκουμέντο από τη ληστεία με καραμπίνα στον Εύοσμο Ελλάδα ,Θεσσαλονίκη ,Σημαντικά

21:5523/01

Εμβόλια: Στη δικαιοσύνη κατά Pfizer/AstraZeneca προσφεύγει η Ιταλία Διεθνή ,Κορωνοϊός

21:5023/01

Κύπρος: Παρέμβαση της Αστυνομίας μετά από εικόνες συνωστισμού Διεθνή ,Κορωνοϊός

21:4523/01

Ιταλία-Covid-19: 13.331 νέα κρούσματα – 488 θάνατοι το τελευταίο 24ωρο Διεθνή ,Κορωνοϊός

21:4023/01

ΗΠΑ-Μεξικό: Σε καλό κλίμα η πρώτη συνομιλία Μπάιντεν-Λόπες Ομπραδόρ Διεθνή

21:3223/01

Κέρκυρα: «Έστρωσε» χαλάζι στο νησί (VIDEO) Κοινωνία

21:3023/01

Ισπανία-Covid-19: Νέοι υγειονομικοί περιορισμοί στη Μαδρίτη Διεθνή ,Κορωνοϊός

21:2123/01

Και η κολχικίνη στη μάχη κατά του κορωνοϊού – Ποιους ασθενείς αφορά Κορωνοϊός ,Σημαντικά

21:2023/01

«Σπάει» μετά από 25 χρόνια η βεντέτα τριών οικογενειών στα Ζωνιανά Κοινωνία

21:1123/01

Κορωνοϊός – Μετάλλαξη: Ακόμη ένα «ορφανό» κρούσμα στην Ελλάδα – Συνολικά 27 Ελλάδα ,Κορωνοϊός ,Σημαντικά

21:1023/01

Ρωσία: Πάνω από 2.000 οι συλλήψεις στις διαδηλώσεις υπέρ του Α. Ναβάλνι Διεθνή

21:0523/01

Βερολίνο: Σε καραντίνα νοσοκομείο μετά από κρούσματα της βρετανικής μετάλλαξης Διεθνή ,Κορωνοϊός

21:0023/01

Γαλλία: Μεταμόσχευση χεριών από τον ώμο για πρώτη φορά στα χρονικά Διεθνή

20:5023/01

Κυρ. Πιερρακάκης: Εξετάζεται το ψηφιακό αντίγραφο πτυχίου Παιδεία ,Πολιτική ,Τεχνολογία

20:4523/01

ΠΟΥ: Νωρίς για συμπέρασμα σχετικά με την προέλευση του κορωνοϊού Διεθνή ,Επιστήμη ,Κορωνοϊός

20:4023/01

Τσαβούσογλου: Τυχόν περιοριστικά μέτρα κατά της Τουρκίας θα καταστρέψουν τα πάντα Διεθνή

20:3023/01

Το Παρίσι χαιρετίζει την πρόταση Μπάιντεν για παράταση της συνθήκης New Start Διεθνή

20:2023/01

Επίτιμος διδάκτορας του Πανεπιστημίου Κρήτης, ο Ηλ. Μόσιαλος Ελλάδα ,Επιστήμη

20:1023/01

Βγήκαν από τη μαύρη λίστα της Γερμανίας η Αττική και το Βόρειο Αιγαίο Διεθνή ,Ελλάδα ,Κορωνοϊός

20:0023/01

Χ. Σταϊκούρας: Επιχειρούμε μια ολιστική προσέγγιση των οφειλών νοικοκυριών και επιχειρή... Οικονομία ,Πολιτική

19:5023/01

Πρόσκρουση φορτηγού οχηματαγωγού πλοίου στο λιμάνι της Μυτιλήνης Κοινωνία

19:4023/01

ΥΠΑ: Συνεχίζονται οι περιορισμοί στις εσωτερικές πτήσεις Ελλάδα ,Κορωνοϊός

19:3023/01

Αδ. Γεωργιάδης: Πρέπει να προσέξουμε, θα είναι κρίμα να πάμε πίσω Πολιτική

19:1523/01

Πέθανε η επίτιμη πρόεδρος του συλλόγου καρκινοπαθών Μακεδονίας-Θράκης Περσεφόνη Μήττα Β.Ελλάδα

19:0623/01

Ο Χρ. Ταραντίλης για τον Στρατηγικό Σχεδιασμό σε διαδικτυακή ημερίδα της ΔΑΠ-ΝΔΦΚ Κόμματα ,Πολιτική

19:0023/01

Ρωσία: Αφέθηκε ελεύθερη η σύζυγος του Ναβάλνι Διεθνή

18:4923/01

Ληστεία με καραμπίνα στη Δ. Θεσσαλονίκη (ΦΩΤΟ) Θέματα GR Times ,Θεσσαλονίκη ,Κοινωνία

18:4523/01

Τηλεφωνική επικοινωνία Ν. Δένδια με τον Μ. Πομπέο Διεθνή ,Ελλάδα

18:3023/01

ΗΠΑ: Θετικοί στον κορωνοϊό βρέθηκαν 100-200 Εθνοφρουροί Διεθνή ,Κορωνοϊός

18:2323/01

Χάρτης κορωνοϊού: «Βράζει» η Αττική – Πού εντοπίζονται τα 605 νέα κρούσματα Ελλάδα ,Κορωνοϊός ,Σημαντικά

18:1523/01

Ζάκυνθος: Δεμένα στο λιμάνι τα πλοία λόγω θυελλωδών ανέμων Κοινωνία

18:0023/01

Η Έν. Δικαστών & Εισαγγελέων καταδικάζει την επίθεση στη δικαστικό Αν. Βαρελά Ελλάδα

17:5823/01

Κορωνοϊός: 605 νέα κρούσματα – 292 διασωληνωμένοι – 24 θάνατοι Ελλάδα ,Κορωνοϊός

17:4523/01

Αλλάζει το όριο επιβατών σε ΙΧ και ταξί Ελλάδα ,Κορωνοϊός

17:3023/01

Ν. Δένδιας: Δεν συζητούμε θέματα εθνικής κυριαρχίας Πολιτική

17:1523/01

Δ. Ωραιοκάστρου: Ολοκληρώθηκαν τα drive through rapid test στη Λητή Δήμοι ,Κορωνοϊός

17:0023/01

Νορβηγία – Κορωνοϊός: Σκληρό lockdown στο Όσλο λόγω…μετάλλαξης Διεθνή ,Κορωνοϊός ,Υγεία

16:4523/01

ΕΛΑΣ: Έρευνα στο κατάστημα κράτησης Πάτρας Ελλάδα

16:4323/01

Ρωσία: Η αστυνομία προφυλάκισε τη σύζυγο του Αλεξέι Ναβάλνι Διεθνή

16:3023/01

Βρετανία: Καθείρξεις 13-27 ετών σε τέσσερις άνδρες για τον θάνατο 39 Βιετναμέζων μετανα... Διεθνή

16:1523/01

Δ. Κορδελιού – Ευόσμου: Αντικατάσταση σηματοδοτών σε κομβικά οδικά σημεία Β.Ελλάδα ,Δήμοι ,Ελλάδα

16:0023/01

Καναδάς: Εξετάζει καραντίνα σε ξενοδοχεία με έξοδα των ταξιδιωτών Διεθνή ,Κορωνοϊός

15:4923/01

Πέθανε από κορωνοϊό ο Λάρι Κινγκ Διεθνή

15:4523/01

Προγνωστικά Στοίχημα: Με το 1.73 στην Μπούντεσλιγκα και Άστον Βίλα Αθλητισμός

15:3023/01

Τροχαία: 1.178 παραβάσεις σε 4.755 ελέγχους στην Κεντρική Μακεδονία Β.Ελλάδα ,Ελλάδα

15:3023/01

Ο Ανδρέας Λοβέρδος ανακοίνωσε την υποψηφιότητά του για την ηγεσία του ΚΙΝΑΛ (VIDEO) Πολιτική ,Σημαντικά

15:1523/01

ΦΕΚ για τα νέα μέτρα προστασίας από τον κωρονοϊό Ελλάδα ,Επιχειρήσεις ,Κοινωνία

15:0023/01

Καιρός: Τρία διαδοχικά κύματα κακοκαιρίας θα “χτυπήσουν” μέχρι την Τετάρτη (27/1) Β.Ελλάδα ,Ειδήσεις ,Ελλάδα

14:4523/01

Γώγος: Αυτές είναι οι τρεις μεταλλάξεις της Covid που ανησυχούν τους ειδικούς Ελλάδα ,Επιστήμη ,Κορωνοϊός

14:3023/01

Θεσσαλονίκη: Συνωστισμός και σε Σούπερ – Μάρκετ (ΦΩΤΟ) Β.Ελλάδα ,Ελλάδα ,Θέματα GR Times

14:1523/01

Κυρ. Μητσοτάκης από το Κέντρο Υγείας στα Καμίνια: Η εκστρατεία εμβολιασμού προχωρά κανο... Ελλάδα ,Επιστήμη ,Κορωνοϊός

14:0023/01

Κίνα – Κορωνοϊός: Ανεβαίνουν και πάλι τα κρούσματα Διεθνή ,Κορωνοϊός

13:4523/01

Από την Πάρμα του Μαλεζάνι στην Ντιφένσα του (μαθητή) Κρέσπο Αθλητισμός

13:3023/01

Βέλγιο-Covid-19: Απαγορεύονται τα «μη αναγκαία ταξίδια» μέχρι την 1η Μαρτίου Διεθνή ,Κορωνοϊός

13:1523/01

Πέλλα: Συνελήφθησαν ενώ έσκαβαν λάκκο για την ανεύρεση αρχαίων Β.Ελλάδα ,Ελλάδα

13:0023/01

Σε εμβολιαστικό κέντρο στα Καμίνια ο πρωθυπουργός Ελλάδα ,Επιστήμη ,Κορωνοϊός

12:4523/01

Ινδία – Κορωνοϊός: Ανακοίνωσε 14.256 κρούσματα και 152 θανάτους Διεθνή ,Κορωνοϊός

12:3023/01

Κορωνοϊός: 1.645 παραβάσεις σε πάνω από 74.000 ελέγχους Ελλάδα ,Κορωνοϊός

12:1523/01

Σκύλος περίμενε επί μέρες τον ιδιοκτήτη του έξω από νοσοκομείο (VIDEO) Διεθνή

12:0023/01

Το Film Office της ΠΚΜ στη διεθνή διαδικτυακή συνάντηση Conventa Trend Bar New Europe 2021 Περιφέρειες

11:5623/01

Θεσ/νίκη: Ουρές χωρίς… τέλος στην αγορά (ΦΩΤΟ-VIDEO) Β.Ελλάδα ,Ελλάδα ,Επιχειρήσεις

11:4523/01

Στοίχημα: Δυάδα από την Basket League Αθλητισμός

11:3023/01

Θεσπρωτία: Σύλληψη αλλοδαπού για κατοχή ναρκωτικών και παράνομη είσοδο Ελλάδα

11:1523/01

Τα νέα της Αυτοκίνησης στην TV100 (VIDEO) Media

11:0023/01

Τι θα ισχύσει με το άνοιγμα Γυμνασίων και Λυκείων – Μήνυμα Κεραμέως Ελλάδα ,Κορωνοϊός ,Παιδεία

10:4523/01

3ο Συνέδριο Θεωρητικής Φυσικής από το Σπουδαστήριο Θεωρητικής Φυσικής ΑΠΘ Θεσσαλονίκη

10:3023/01

Εξαδάκτυλος: Μπορούμε να απωθήσουμε το τρίτο κύμα κορωνοϊού Ελλάδα ,Επιστήμη ,Κορωνοϊός

10:1523/01

Γεραπετρίτης: Πανελλαδικό δίκτυο επιτήρησης των μεταλλάξεων του κορωνοϊού Ελλάδα ,Κορωνοϊός ,Πολιτική

10:0023/01

Ξηροί καρποί: Ποιοι τύποι είναι οι πιο υγιεινοί; Health-Fitness ,Θέματα GR Times ,Υγεία

09:4523/01

Θεσ/νίκη: Ταυτοποιήθηκαν οι δράστες της οπαδικής επίθεσης με όπλο Β.Ελλάδα ,Ελλάδα ,Θεσσαλονίκη

09:3023/01

Κορωνοϊός – ΠΟΥ: Αποτελεσματικές οι υφασμάτινες μάσκες και στις μεταλλάξεις Διεθνή ,Επιστήμη ,Κορωνοϊός

ΕΠΟΜΕΝΟ ΘΕΜΑ
ΕΠΟΜΕΝΟ ΘΕΜΑ